IQUISA participa en el programa voluntario promovido por el gobierno mexicano a través de la Secretaría del Medio Ambiente y Recursos Naturales (SEMARNAT) y la Procuraduría Federal de Protección al Ambiente (PROFEPA) denominado “Industria Limpia”. Con este proceso se busca la identificación, evaluación y control de los procesos de las plantas que pudiesen estar operando bajo condiciones de riesgo o provocando contaminación al ambiente. Desde 1997 a la fecha, se mantienen vigentes los certificados aprobatorios para las tres plantas mencionadas.